MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 9626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002944	GAC	2	6	1591597	1591602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_002944	CG	3	6	1591628	1591633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_002944	CCG	2	6	1591649	1591654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_002944	CCA	2	6	1591655	1591660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_002944	CAC	2	6	1591666	1591671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_002944	CAG	2	6	1591687	1591692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_002944	TGA	2	6	1591808	1591813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_002944	CGC	2	6	1591824	1591829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_002944	GCTGC	2	10	1592966	1592975	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3010	NC_002944	TCG	2	6	1592984	1592989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_002944	CGCC	2	8	1592999	1593006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3012	NC_002944	CGG	2	6	1593021	1593026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_002944	AGC	2	6	1593034	1593039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_002944	CGT	2	6	1593057	1593062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_002944	CCGGG	2	10	1593063	1593072	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3016	NC_002944	GGC	2	6	1595729	1595734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_002944	GC	3	6	1595776	1595781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_002944	CGG	2	6	1595940	1595945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_002944	TCC	2	6	1595979	1595984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_002944	GCG	2	6	1596053	1596058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_002944	GCT	2	6	1596155	1596160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_002944	ACC	2	6	1597411	1597416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_002944	CCGA	2	8	1599056	1599063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_002944	GCC	2	6	1599070	1599075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_002944	GCA	2	6	1600777	1600782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_002944	GCG	2	6	1600813	1600818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_002944	CGA	2	6	1600861	1600866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_002944	CCG	2	6	1600937	1600942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_002944	GGT	2	6	1600972	1600977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_002944	GTCGAC	2	12	1601015	1601026	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_002944	CGA	2	6	1601120	1601125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_002944	GAC	2	6	1601146	1601151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_002944	AGC	2	6	1601183	1601188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_002944	CG	3	6	1601204	1601209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_002944	CGC	2	6	1605986	1605991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_002944	TCG	2	6	1608333	1608338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_002944	CG	3	6	1608358	1608363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_002944	TGC	2	6	1608438	1608443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_002944	CGT	2	6	1611353	1611358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_002944	ATTT	2	8	1611372	1611379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_002944	CG	4	8	1611390	1611397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_002944	GGC	2	6	1611504	1611509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_002944	CTG	2	6	1611577	1611582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_002944	CATCG	2	10	1613169	1613178	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3045	NC_002944	CGA	2	6	1614129	1614134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_002944	AAC	2	6	1614143	1614148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_002944	ACTC	2	8	1614175	1614182	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_002944	CCG	2	6	1614243	1614248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_002944	CGGT	2	8	1614251	1614258	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_002944	CGC	2	6	1614407	1614412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_002944	CAG	3	9	1614429	1614437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_002944	CGG	2	6	1614505	1614510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_002944	GGC	2	6	1614762	1614767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_002944	CG	3	6	1614796	1614801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_002944	CCG	2	6	1615739	1615744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_002944	CGA	2	6	1615758	1615763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_002944	GCC	2	6	1616477	1616482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_002944	GC	4	8	1616484	1616491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_002944	ACC	2	6	1616518	1616523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_002944	GGCC	2	8	1616524	1616531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_002944	GCCTGG	2	12	1616594	1616605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_002944	CCG	2	6	1617358	1617363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_002944	TCG	2	6	1617366	1617371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_002944	GCA	2	6	1619262	1619267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_002944	GT	3	6	1619279	1619284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_002944	CGC	2	6	1619914	1619919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_002944	GCC	2	6	1619931	1619936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_002944	CGG	2	6	1619948	1619953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_002944	GGA	2	6	1619975	1619980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_002944	ACG	2	6	1622120	1622125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_002944	AGCCT	2	10	1622188	1622197	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3072	NC_002944	CGC	2	6	1622200	1622205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_002944	AGTT	2	8	1623156	1623163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_002944	TCA	2	6	1626326	1626331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_002944	CGC	2	6	1626380	1626385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_002944	CGG	2	6	1626486	1626491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_002944	GGC	2	6	1626506	1626511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_002944	CGG	2	6	1626519	1626524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_002944	ACG	2	6	1626530	1626535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_002944	TCG	2	6	1626557	1626562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_002944	CCG	2	6	1626579	1626584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_002944	CGGC	2	8	1627858	1627865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_002944	TGA	2	6	1628798	1628803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_002944	GGT	2	6	1628829	1628834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_002944	CACCG	2	10	1628851	1628860	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3086	NC_002944	CAG	2	6	1628955	1628960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_002944	ATG	2	6	1629010	1629015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_002944	CGG	2	6	1631960	1631965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_002944	ACTA	2	8	1632119	1632126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_002944	GCT	2	6	1633080	1633085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_002944	CGCC	2	8	1633098	1633105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3092	NC_002944	CGC	2	6	1633457	1633462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_002944	AGC	2	6	1633501	1633506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_002944	GGT	3	9	1633542	1633550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_002944	CGA	2	6	1633611	1633616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_002944	CGG	3	9	1633650	1633658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_002944	AGG	2	6	1633676	1633681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_002944	ACC	2	6	1634037	1634042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_002944	CGG	2	6	1634052	1634057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_002944	CGCCGG	2	12	1634111	1634122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_002944	CCCG	2	8	1634134	1634141	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3102	NC_002944	CGCTG	2	10	1634181	1634190	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3103	NC_002944	GC	3	6	1634195	1634200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_002944	TCA	2	6	1636178	1636183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_002944	GTGG	2	8	1636193	1636200	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_002944	GGA	2	6	1636916	1636921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_002944	CTG	2	6	1637665	1637670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_002944	GCG	2	6	1637733	1637738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_002944	GCC	2	6	1639752	1639757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_002944	CTG	2	6	1639801	1639806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_002944	CGG	2	6	1639819	1639824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_002944	CG	4	8	1639836	1639843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_002944	TGC	2	6	1643393	1643398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_002944	CGT	2	6	1643440	1643445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_002944	GCC	2	6	1643458	1643463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_002944	GGCCG	2	10	1643476	1643485	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3117	NC_002944	CGGG	2	8	1643486	1643493	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_002944	CGT	3	9	1643496	1643504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_002944	GGA	2	6	1643544	1643549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_002944	GGGA	2	8	1643582	1643589	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_002944	GGT	2	6	1643619	1643624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_002944	GCG	2	6	1643625	1643630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_002944	GGT	2	6	1643743	1643748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_002944	AGG	2	6	1650958	1650963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_002944	TGGC	2	8	1651257	1651264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_002944	TGA	2	6	1651268	1651273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_002944	CGC	2	6	1651299	1651304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_002944	CA	3	6	1651342	1651347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_002944	TGA	2	6	1651369	1651374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3132	NC_002944	GCCG	2	8	1651476	1651483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3162	NC_002944	TCA	2	6	1655811	1655816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3251	NC_002944	GACA	2	8	1690515	1690522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3259	NC_002944	AGAGGA	2	12	1693574	1693585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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